为了确保移民利益只为合格的申请人所享有，美国移民局采取背景安全调查的程序来免除很大一部分的风险，所有受益人，不论国籍、种族、宗教信仰如何都必须经过调查。

根据1974年的隐私法(Privacy Act of 1974)，美国国土安全部(Department of Homeland  Security,DHS)以及移民局(U.S. Citizenship and Immigration  Services,USCIS)建议增加一套新的系统用于记录调查结果，即背景调查系统(BCS)。这套系统已经于2007年1月3日开始实行。

不同类别的申请会经受不同级别的调查。移民局通常采用以下四类安全检查，但是保留了必要时进行其它安全检查的权力：

各机构间边境检查系统的姓名核查(Name Check)：

各机构间边境检查系统(Interagency Border Inspection System，IBIS)是一个多重机构，它有一个中心系统，致力于从多个部门、信息库和系统界面搜集信息，并将这些信息汇总成一个有关国家安全风险、公共安全问题和法律实施关系的数据库。

移民局能够快速地从这些多重政府机构中核查信息，以决定系统中的信息是否会影响案件的判决。

IBIS核查的结果一般很快就可以出来。但在一些案件处理过程中，IBIS核查出来的信息需要进一步地调查，IBIS检查的所有疑点都必须从最初的系统中得到答案后才可以有结果。

美国联邦调查局(FBI)的指纹检查(Fingerprint Check)

这个检查适用于很多申请者。FBI指纹检查的是在美国境内的犯罪背景。一般地，FBI会在24到48个小时之内向移民局提交检查结果。如果发现指纹与一个记录相匹配，FBI就会把相关犯罪历史(RAP sheet)的电子复本转给移民局。然后，移民官员会再次审核有关信息来决定该申请者是否能够合法地享有移民利益。尽管大部分的调查结果是无记录或无匹配，但是其中确有10%被揭露有犯罪历史(包括违反移民法)。
 
在涉及拘留或者被起诉的案子中，移民局要求申请人提供一些鉴定处理证明。以前曾被拘留的移民人士应该在申请时向移民法官提供整套被鉴定的处理记录，以免你的犯罪历史遭误会而导致你的申请被延迟或拒绝。即使是被清洗或被撤销的定罪也必须上报说明。

美国联邦调查局(FBI)姓名核查(Name Check)

姓名核查也适用于很多申请者，但它和指纹检查是完全不同的。FBI姓名核查过程的记录由行政人员、申请者、罪犯、职员和其他的一些人员组成，这些记录是由法律强制编入的。指纹检查的初步结果一般要两个星期后才能知道。大约80%的案件不能找到匹配。对于剩下的20%，其中大部分会在六个月之内得到解决。有不到1%的案件的处理时间会超过六个月，因为其中有一些复杂敏感的案子无法快速地处理。即使FBI给出了匹配的初步结果，也并不代表姓名核查已经结束。要等到所有的信息被获得，确定没有疑点后，姓名核查才算是完成了。

领事馆内部调查

有专门的调查组去进行电话调查或实地调查，综合申请人提交的申请资料，过去的签证记录及其他部门提供的文件资料，做一个系统的背景安全调查。
 
这套系统将由移民局将控制引导，有利于加快背景调查的速度，提高移民局办事效率。移民局将会把这套系统作为一个个中央的存储数据库，用于存储背景调查中所有相关的请求和结果。这样移民局和服务中心人员在处理案件的过程中，就可以从这个新的系统中确认和调取储存的资料，以便做出正确的裁决。